Laserleikkaus ei edistä tai estä muiden silmäsairauksien, kuten harmaakaihin, silmäpainetaudin, silmänpohjarappeuman tai verkkokalvoirtauman kehittymistä. Laserleikkaus ei ole este näiden sairauksien hoidolle, kuten esimerkiksi harmaakaihileikkaukselle. Laserleikkaus ei myöskään heikennä silmän iskunkestävyyttä eikä muutenkaan vaurioita silmää. Kenenkään ei tiedetä sokeutuneen laserleikkauksen seurauksena.

• Tavallinen sivuvaikutus on silmien kuivuminen ensimmäisten kuukausien aikana leikkauksen jälkeen, mikä ilmenee roskan tunteena silmässä. Vaiva on autettavissa kostutustipoin, joita saa apteekista ilman reseptiä. Myös voidetta voi käyttää.
• Aurinkolaseja on hyvä käyttää ulkona ollessa kirkkaassa auringonvalossa ensimmäisten kuukausien ajan.
• Hämärässä ja pimeässä näkeminen voi leikkauksen jälkeen olla tilapäisesti jonkin verran heikompaa kuin ennen leikkausta, mikä ilmenee ylimääräisten valorenkaiden näkemisenä tai häikäistymisenä. Vaiva häviää muutaman kuukauden kuluessa. Turun Silmälaserissa käytössä oleva Zeiss MEL 80 -laserlaite tekee korjauksen riittävän laajalle alueelle ihanteellisella profiililla, minkä vuoksi hämäränäköongelmia ei pysyvästi ole.
• Joskus tarvitaan uusintaleikkaus, jos haluttua taittovoimaa ei ensimmäisen leikkauksen jälkeen saavuteta. Tämä johtuu sarveiskalvon paranemisominaisuuksista, jossa on jonkin verran yksilöllistä vaihtelua. Uusintaleikkauksia on Turun Silmälaserissa tehty sen koko toiminnan aikana vain noin kahdelle prosentille kaikista potilaista. Tulosta voidaan pitää hyvänä, sillä kansainvälisten tutkimusten mukaan uusintaleikkausten tarve on keskimäärin noin 10-20 %. Uusintaleikkaus tehdään Turun Silmälaserissa takuuhintaan.
• LASIK-leikkauksessa sarveiskalvon läpän teossa voi joskus olla ongelmia. LASIK-toimenpide voidaan tämän takia joskus joutua keskeyttämään eikä laserointia tehdä sillä kerralla. Noin puolen vuoden kuluttua voidaan tehdä uusi LASIK-leikkaus. Läppäkomplikaatiot ovat hyvin harvinaisia, koska käytämme LASIK-leikkauksessa korkeatasoista mikrokeratomilaitteistoa, jonka säätömahdollisuuksien ansiosta läppä voidaan tehdä turvallisesti hyvin erilaiset mittasuhteet omaaviin sarveiskalvoihin. FemtoLasik-leikkauksessa taas läppäkomplikaation mahdollisuus on häviävän pieni.
• Joskus harvoin läpän alle voi ensimmäisten viikkojen aikana kasvaa sarveiskalvon epiteeliä eli pintakerrosta. Useimmiten pintakerros häviää itsestään, tarvittaessa läppä puhdistetaan kirurgisesti.
• PRK- ja LASEK-leikkauksen seurauksena voi ilmetä arpisamentumaa, jota hoidetaan lääkityksellä.
• Kortisonitipoista johtuen silmän sisäinen paine voi nousta. Hoitona on tippojen vaihtaminen tai painetta alentavien silmätippojen käyttö. Paineenousuongelma voi esiintyä käytännössä vain PRK:ssa, koska siinä tippoja käytetään pitkään (3 kk).
• Kuten minkä tahansa leikkauksen seurauksena, leikkausalue voi myös tulehtua. Tulehdusriskin arvioidaan sarveiskalvon laserleikkauksissa olevan noin promillen luokkaa.