En laseroperation varken påskyndar eller förhindrar utvecklingen av andra ögonsjukdomar såsom grå starr, ögontryckssjukdom, ögonbottendegeneration eller näthinneavlossning. En laseroperation utgör inget hinder för behandlingen av dessa sjukdomar, som till exempel en gråstarrsoperation. En laseroperation gör inte heller ögat mindre tåligt för stötar och skadar det inte heller på något annat sätt. Enligt vad man vet har ingen blivit blind till följd av en laseroperation.

• En vanlig biverkning är torra ögon under de första månaderna efter operationen, vilket tar sig uttryck i en känsla av att man har fått något i ögat. Besväret kan avhjälpas med fuktande droppar som fås på apoteket utan recept. Man kan även använda kräm.
• Det är bra att använda solglasögon utomhus om man vistas i klart solljus under de första månaderna.
• Dunkel- och mörkerseendet kan tillfälligt vara något sämre efter operationen än före den, vilket visar sig som extra ljusringar runt föremål eller bländning. Besväret försvinner efter några månader. Laserapparaten Zeiss MEL 80, som används på Turun Silmälaser, gör korrigeringen över ett tillräckligt stort område med en idealisk profil varför problem med dunkelseendet inte förekommer permanent.
• Ibland behövs en omoperation om den önskade brytningskraften inte uppnåddes efter den första operationen. Ögats brytningskraft kan även över- eller underkorrigeras som en reaktion på sårläkningen. Vid Turun Silmälaser har omoperationer utförts på endast cirka två procent av alla patienter under hela den tid verksamheten har pågått. Resultatet kan anses vara gott, eftersom internationella studier visar på ett behov av förnyade operationer på i genomsnitt 10–20 procent av patienterna. Turun Silmälaser utför omoperationen till ett garantipris.
• Efter PRK- och LASEK-operationer kan ärrbildning förekomma, vilken behandlas med medicinering.
• Vid LASIK-operationer kan det ibland förekomma problem i samband med att fliken hyvlas. Man kan bli tvungen att avbryta operationen på grund av detta och laserbehandlingen utförs då inte den gången. Efter cirka ett halvt år kan en ny LASIK-operation utföras. Vid Turun Silmälaser används mikrohöylälaitteistoa som står för nyaste teknik (Moria M2: Carazio-Barraquer, Evolution) och som möjliggör att fliken i hornhinnan görs
• I sällsynta fall kan det under de första veckorna efter operationen börja växa hornhinneepitel under fliken. För det mesta försvinner epitelet av sig självt, vid behov rengörs fliken kirurgiskt.
• Om hornhinnan är för tunn för en LASIK-operation, görs ingreppet med LASEK- eller PRK-metoden. Att hornhinnan är tunn är dock sällan ett hinder för ett LASIK-ingrepp, eftersom vår mikrokeratomutrustning gör det möjligt att göra en flik som är tunnare än vanligt.
• Om man inte lyckas med att rulla epitelskiktet vid en LASEK-operation, utförs ingreppet som vid PRK.
• Ögontrycket kan stiga till följd av kortisondropparna. Detta behandlas genom att man byter droppar eller sätter in droppar som sänker trycket. Problem med ögontrycket kan i praktiken förekomma endast vid PRK där droppar används länge (3 mån.).
• Såsom vid vilken annan operation som helst kan operationsområdet bli inflammerat. Risken för inflammation uppskattas vara cirka en promille vid laseroperationer av hornhinnan.